Het Bestuursbureau bestaat uit Bestuurszaken en Onderwijs, Onderzoek en Kwaliteitszorgzaken. Binnen het Bestuursbureau is tevens de ambtelijke ondersteuning van de centrale medezeggenschapsraad (CMR) ondergebracht.
De Gemeenschappelijke Dienst verzorgt gemeenschappelijke diensten en producten voor de gehele HKU en omvat de volgende afdelingen:
• Ondersteuning en Beheer
• Studenten Service Centrum (SSC)
• Servicecentrum Financiën en Personeel
• Planning & Control
• Computerdienst
• Netwerk- en informatiedienst
• Bureau Communicatie
• Interne opleidingen
• Netwerk Internationale Zaken
• Netwerk Interculturele Zaken
• Netwerk Facilitaire Zaken
De HKU telt 5 faculteiten die het onderwijs verzorgen. De faculteiten kennen elk een eigen bestuur en medezeggenschapsraad (FMR). Aan iedere faculteit is een projectenbureau verbonden, dat zorgt voor een goede uitvoering van onder meer exposities, concerten en theatervoorstellingen en dat opdrachten verwerft voor studenten.
